Créée en 1979 par deux hommes du pays, Georges Berthet et Jacky Mandrillon, tous les deux passionnés des disciplines nordiques, la Transjurassienne est le plus grand évènement nordique français et la seule épreuve nationale membre de la Worldloppet (Fédération internationale des courses longues distances en ski de fond). L'édition 1979 n'a pas eu lieu pour manque de neige. La première édition (elle s'appelait alors la Progressime) fut remportée par le Suédois Tommy Limby en 4h04. La Progressime est devenue la Transjurasienne en 1983 avec comme vainqueur le Suisse Konrad Hallenbarter en 3h34. Le premier vainqueur français fut Hervé Balland en 1991 s'imposant en 3h05 devant son frère Guy Balland et Pascal Moyse.

Traversant les Montagnes du Jura en Franche Comté, cette compétition populaire attirant quelque 4 000 fondeurs comporte des courses de différentes distances, en style libre et en pas alternatif. Elle se déroule chaque année début février. La course élite, réservée aux sportifs chevronnés se dispute sur 76 km entre Lamoura et Mouthe chez les hommes et sur 54 km chez les femmes avec un départ des Rousses. Le parcours traverse les départements du Jura et du Doubs (en passant par les villages de Prémanon, Les Rousses, Bois-d'Amont, Le Brassus, Bellefontaine, Chapelle-des-Bois, Le Pré Poncet, Chaux-Neuve et Petite-Chaux) avec une petite incursion en Suisse dans la Vallée de Joux.

La Transju 2016, 2020 et 2024 n'ont pas eu lieu à cause de la pluie et la manque de neige puis l'édition 2021 a été annulée en raison de la pandémie de Covid-19.

En février 2019, la 'Transju' a fêté ses 40 ans. Elle a eu lieu les 9 et 10 février 2019 avec quelque 2 500 participants de 30 nationalités différents dans la course élite pour un total de 4 372 skieurs pour les cinq courses du week-end. Elle a emprunté un parcours inédit de 47 km entre Bois d’Amont et Prémanon, en passant par Les Rousses et Lamoura.

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